Измена наставног плана и измена режима студија су наметнути новим
Законом о високом образовању који је донет септембра 2005. године, а морао да буде примењен до септембра 2007. године. Значи, то није била воља Факултета, већ обавеза поштовања закона. Што се тиче спремности за примену закона, Економски факултет и Нишу је први завршио цео процес имплементације закона и први је од свих економских факултета (државних и приватних) добио акредитацију
Комисије за акредитацију и проверу квалитета РС (дозволу за рад у складу са новим законом).
Звање дипломираног економисте се по новом закону добија након завршетка дипломских - мастер студија и факултет је у обавези да то поштује. Одлуку о изједначавању диплома донала је
Скупштина РС и ту одлуку је факултет такође у обавези да испоштује.
По старом наставном плану тренутно функционишу још само трећа и четврта година студија, а за две године комплетна настава ће се одвијати по новом наставном плану. Што се тиче литературе, Наставно-научно веће је донело одлуку да се до тог рока сви уџбеници на факултету морају ускладити са усвојеним
Стандардима за уџбенике по новом наставном плану.
Што се школарине тиче, Економски факултет у Нишу има најнижу школарину од свих факултета и високих школа из области економије и менаџмента. Неке високе школе и факултети наплаћују и оверу семестра, што се не приказује кроз цену школарине. Висине школарина на појединим факултетима у Србији можете видети у чланку који је издао "Блиц" на следећој адреси
http://www.blic.rs/drustvo.php?id=87560, видећете да остали факултети имају далеко више школарине.